为平衡世界光明和黑暗，为疏导人类与决斗怪兽自己的渊源，为了平衡世界七大神器，为了保护自己的哥哥——武藤游戏。
- 开局遇意外，坠机启征程
- 踏铁鞋觅处，遇海马兄弟
- 豪掷一千万 ，剧情进行时
- 命运的起点，奇迹的开端
- 祸从口出，引火烧身
- 暗游戏上线，羁绊的开始
- 红莲灼心火，战栗的白龙
- 未来的憧憬，贝卡斯邀请
- 透视挂千年眼，游戏战贝卡斯
- 羽蛾的算计，失去大法师
- 登录决斗岛，游戏战羽蛾
- 宿命的联结，恋爱的牌局
- 猎物的反击，食物的决斗
- 海马的危机，暗中的监视
- 内心的觉醒，自我的救赎
- 游戏的震惊，海马的动作
- 一波未平，一波又起
- 赌狗城之内，真红眼黑龙
- 貘良的求助，邪恶千年轮
- 梦境决斗，化险为夷
- 生命不息，决斗不止
- 海马战城之内，一面倒的决斗
- 噩梦般的决斗，城之内的觉悟
- 另辟蹊径，灵魂指引
- 须藤救场，判官觉醒
- 决战前夕，须藤护佑
- 黑暗游戏，震惊众人
- 第一场比赛，游戏的抉择
- 赌狗的信仰，霍华德作弊
- 战半决赛，兄弟情谊
- 绝处逢生，千年积怨
- 终焉始末，千年之心
- 无尽征程，新的开始
- 海马落入陷阱，游戏带队营救
- 虚拟现实，双重危机
- 须藤到访，拯救海马
- 五神龙祭品，海马的考验
- 狸猫换太子，兄弟重逢时
- 绝望序曲，龙族传承
- 新转校生，波澜再起
- 久违的决斗，城之内吃瘪
- 目的达到，游戏出战
- 误会与偏见，沉遂的渊源
- 冰释前嫌，波澜再起
- 法老王被盗，游戏走单骑
- 交锋开始，各方云动
- 初战马利克，游戏遭暗算
- 游戏遭孽障，患难见真情
- 三幻神现，千年首饰
- 作品设定
- 人物性格和创作思路
- 决斗城市，开始之时
- 黑暗降临，临危受命
- 须藤首战，黑暗退散
- 小小羽蛾，也敢放肆
- 世人彷徨，唯吾张扬
- 峰回路转之时，魔导重铸之日
- 禁卡出世，搅动阴阳
- 大彻大悟，废材蜕变
- 超能力者，水落石出
- 决斗插曲，心灵博弈
- 强运傍身，旗开得胜
- 守墓者之辛，马利克之怒
- 魔导尽头谁为峰，一遇须藤道成空
- 人偶袭击事件，马利克的馈赠
- 神之降世，各方云动
- 命悬一线，兄弟情谊
- 番外一：从黑手帮里挖人（系第66章）
- 机车少年，追猎开始
- 黑白假面，基友联合
- 深海行动，黑暗涌出
- 海的诱惑，缺乏抵抗
- 黑暗涌动，决赛前夕
- 浑身解数，庸才新秀
- 梅开二度，楼台死斗
- 假面卡组，基友联合
- 双人鏖战，合作分歧
- 尘埃落定，目标转移
- 层层递进，步步为营
- 假面骑士，围追堵截
- 接二连三，阿福出战
- 以六武之名，铸强者之心
- 守墓者之心，世代的枷锁
- 码头生死战，患难见真情
- 城之内决斗，马利克操纵
- 命运交织，岁月羁绊
- 风暴前夕，高潮迭起
- 绝境尚存，一线希望
- 落幕之时，终焉之刻
- 风暴终临，趋于平静
- 正面交锋，须藤警告
- 陵园小夜曲，黑暗的扩张
- 乌龙拍档，决赛风云
- 全员到齐，整装待发
- 一人之心，千夫所指
- 以爱之名，须藤觉悟
- 第一场，须藤VS貘良
- 绝境逢生，须藤发力
- 黑暗空间，兄弟情谊
- 身陷囹圄，心静极致
- 判官之名，众生之心
- 潜龙勿用，藏锋守拙
- 茶余饭后，闲点时间
- 番外二，新年
- 第二场，城之内VS利希德
- 陷阱卡组，排雷庸才
- 神罚终降临，拉的翼神龙
- 第三场，孔雀舞VS马利克
- 太阳神之谜，决斗者之密
- 业火映寂空，绝志绽黎明
- 第四场，海马VS伊西丝
- 既定的命运，意外的结局
- 黑暗侵蚀，灵魂归属
- 决赛风云，各方云动
- 四人乱斗，预选风云
- 决斗开始，各怀鬼胎
- 经典之战，游戏VS海马
- 千年羁绊，终将落幕
- 挑战高峰，永不言弃
- 以武者之心，铸六武之名
- 破局之战，须藤VS马利克
- 审判者之感，守墓者之殇
- 拉锯战之争，单方面接管
- 烈日灼心，熔岩魔神
- 诸神黄昏，终焉落幕
- 既别之时，何须挂念
- 家族之密，血腥过往
- 约定决斗，波澜不惊。
- 二女探情，何为爱情？
- 结界之力，奥利哈刚。
- 决斗具象，怪兽危机。
- 预言成真？世界毁灭？
- 扬汤止沸，釜底抽薪。
- 三幻神现，黑暗蔓延
- 多玛的三骑士，奥利哈刚之力
- 奥利哈刚结界，须藤VS黑袍人。
- 暴雨终倾，战斗打响。
- 洗脑专家，传销组织。
- 不是冤家不聚头，不是同行不聚首。
- 无名之龙，世界之秘。
- 记忆石板，心灵迷宫。
- 黑暗触手，逐一击破。
- 黑暗终临，各方云动。
- 耳听为虚，眼见为实。
- 首战，海马VS亚美鲁达
- 前代恩怨，战争遗孤。
- 线索又断，功亏一篑。
- 潜入，须藤VS拉斐尔
- 黎明，黑暗的序曲。